MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 2905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015470	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015470	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015470	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015470	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015470	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015470	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015470	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015470	T	6	6	3102	3107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015470	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015470	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015470	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015470	T	6	6	6676	6681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015470	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015470	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015470	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015470	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015470	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015470	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015470	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015470	ACA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015470	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015470	GTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015470	TGT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015470	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015470	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015470	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015470	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015470	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015470	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015470	TCC	2	6	18548	18553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015470	TAA	2	6	18575	18580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015470	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015470	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015470	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015470	T	6	6	20378	20383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015470	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015470	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015470	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015470	T	9	9	21770	21778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015470	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015470	T	6	6	21810	21815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015470	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015470	A	6	6	23887	23892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015470	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015470	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015470	T	6	6	26579	26584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015470	TTC	2	6	26614	26619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015470	ATTT	2	8	26655	26662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015470	ATTA	2	8	26666	26673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015470	TTA	2	6	26697	26702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015470	A	6	6	30339	30344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015470	TTTC	2	8	31651	31658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015470	AGG	2	6	31745	31750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015470	T	6	6	31769	31774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015470	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015470	AGA	2	6	31968	31973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015470	CTT	2	6	31983	31988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015470	TCTA	2	8	32055	32062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015470	A	6	6	32364	32369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015470	AATT	2	8	32379	32386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015470	AAT	2	6	32408	32413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015470	TTAA	2	8	32419	32426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015470	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015470	AAG	2	6	33450	33455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015470	A	6	6	33506	33511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015470	TTAA	2	8	33515	33522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015470	TGT	3	9	33529	33537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015470	AGAT	2	8	33558	33565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015470	AAG	2	6	33574	33579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015470	ATTTAA	2	12	33597	33608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015470	TGG	2	6	34231	34236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015470	ATAAA	2	10	34286	34295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015470	A	6	6	34303	34308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015470	TTC	2	6	37590	37595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015470	TTC	2	6	37631	37636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015470	TGC	2	6	37679	37684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015470	TC	3	6	37741	37746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015470	TCAA	2	8	37780	37787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015470	AGA	2	6	37869	37874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015470	TAT	2	6	38104	38109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015470	GAA	2	6	39480	39485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015470	TTA	2	6	42386	42391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015470	GAA	2	6	42408	42413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015470	A	6	6	43437	43442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015470	GTT	2	6	43449	43454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015470	GAC	2	6	44141	44146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015470	ACG	2	6	44176	44181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015470	GTCG	2	8	44199	44206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015470	GTC	2	6	44217	44222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015470	GAA	2	6	49512	49517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015470	ATAA	2	8	49532	49539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015470	A	6	6	49541	49546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015470	TA	3	6	52215	52220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015470	GAT	2	6	52231	52236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015470	TCG	2	6	52298	52303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015470	TTG	2	6	52313	52318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015470	T	6	6	52329	52334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015470	T	8	8	52364	52371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015470	GTC	2	6	52417	52422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015470	A	6	6	52453	52458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015470	TTTTG	2	10	52488	52497	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015470	AAG	2	6	52517	52522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015470	AAAG	2	8	52612	52619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015470	TTTA	2	8	52622	52629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015470	GAAG	2	8	52725	52732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015470	CCT	2	6	52735	52740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015470	T	6	6	52747	52752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015470	TGC	2	6	52813	52818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015470	CCT	2	6	52819	52824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015470	TGC	2	6	52825	52830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015470	AGG	2	6	52844	52849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015470	A	6	6	54480	54485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015470	T	7	7	54505	54511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015470	AAT	2	6	54533	54538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015470	AAAG	2	8	54790	54797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015470	GTT	2	6	57784	57789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015470	TGG	2	6	57864	57869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015470	TTAAT	2	10	57968	57977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015470	GGT	2	6	58093	58098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015470	A	8	8	58102	58109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015470	ATT	2	6	59559	59564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015470	TTA	2	6	59586	59591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015470	A	6	6	59608	59613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015470	TAA	2	6	59660	59665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015470	AGA	2	6	59736	59741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015470	GTTT	2	8	59896	59903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015470	TATG	2	8	59911	59918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015470	CTA	2	6	59975	59980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015470	CAA	2	6	63299	63304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015470	TG	3	6	63308	63313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015470	TTG	2	6	64380	64385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015470	A	8	8	64390	64397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015470	GAA	2	6	64408	64413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015470	TCC	2	6	64493	64498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015470	CTTT	2	8	64571	64578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015470	AAT	2	6	64639	64644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015470	GATA	2	8	70219	70226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015470	AG	3	6	70238	70243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015470	GTC	2	6	70293	70298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015470	AGA	2	6	70337	70342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015470	T	7	7	71075	71081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015470	A	7	7	71125	71131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015470	CACTT	2	10	71133	71142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015470	ATA	2	6	71241	71246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015470	T	6	6	72126	72131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015470	TTA	3	9	74093	74101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015470	ATC	2	6	76090	76095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015470	TCA	2	6	77415	77420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015470	TTC	2	6	77492	77497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015470	TAT	2	6	77524	77529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015470	TAAT	2	8	77664	77671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015470	TATT	2	8	77681	77688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015470	TTAA	2	8	77690	77697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015470	TAAA	2	8	77721	77728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015470	ATTA	2	8	77738	77745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015470	AATTT	2	10	77746	77755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015470	ATTATA	2	12	77760	77771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015470	TAT	2	6	77783	77788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015470	AGA	2	6	80496	80501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015470	TAAA	2	8	80502	80509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015470	AAT	2	6	80592	80597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015470	T	6	6	81803	81808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015470	TGT	2	6	81813	81818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015470	T	6	6	81860	81865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015470	T	6	6	81875	81880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_015470	AGA	2	6	83164	83169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015470	TGT	2	6	83236	83241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015470	TCT	2	6	83242	83247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_015470	ATC	2	6	84794	84799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_015470	AGAAA	2	10	87355	87364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015470	GTT	2	6	87384	87389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015470	TTTA	2	8	87395	87402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015470	T	7	7	87413	87419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015470	T	7	7	87433	87439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015470	T	6	6	87463	87468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_015470	AAG	2	6	93554	93559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_015470	TA	4	8	125327	125334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015470	AAT	2	6	125767	125772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015470	ATT	2	6	128310	128315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_015470	T	7	7	128405	128411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015470	TG	3	6	128430	128435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015470	T	6	6	128444	128449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015470	A	6	6	128461	128466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_015470	TGT	2	6	128541	128546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015470	AC	3	6	128564	128569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_015470	ACA	2	6	128613	128618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_015470	TAC	2	6	128629	128634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_015470	TTTA	2	8	128694	128701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015470	T	6	6	130183	130188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015470	AT	3	6	130241	130246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015470	CTT	2	6	130364	130369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_015470	ATT	2	6	130471	130476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015470	AGG	2	6	130491	130496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_015470	CT	3	6	130620	130625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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